中山大学与阿里云合作,利用ai和云计算技术取得重大突破,在国际顶级学术期刊《cell》上发表了最新研究成果。该研究发现了180个超群和超过16万种全新rna病毒,是已知病毒数量的近30倍,极大地扩展了人们对rna病毒多样性和演化历史的认知。
这项研究采用了一种基于深度学习的RNA病毒发现方法,标志着深度学习技术在病毒学研究领域的里程碑式进展,为病毒研究开辟了新的途径。《Cell》作为生命科学领域的顶级期刊,其发表论文的竞争异常激烈,此次成果的入选充分证明了其研究价值。
传统病毒鉴定方法依赖于序列同源性比对,效率低下且难以识别缺乏同源性的“暗物质病毒”。而这项研究利用全新的深度学习模型“LucaProt”,有效解决了这一难题。“LucaProt”模型基于Transformer框架和大模型表征技术,结合蛋白质序列和结构特征,在独立测试数据集上展现出极高的准确性和特异性,假阳性率仅为0.014%,假阴性率为1.72%。
研究团队分析了来自全球10,487份生物环境样本数据,发现了513,134条病毒基因组,涵盖161,979个潜在病毒种和180个RNA病毒超群。这使得RNA病毒超群数量增加了约9倍,病毒种类增加了约30倍。其中,23个超群无法通过传统方法识别,代表了病毒世界的“暗物质”。
此外,该研究还取得了其他重要发现,例如发现了迄今为止最长的RNA病毒基因组(47,250个核苷酸),揭示了RNA病毒基因组进化的新机制,以及在极端环境(如深海热泉)中RNA病毒的多样性。
中山大学医学院教授施莽指出,AI在科学研究中的应用已成为不可逆转的趋势,并为探索科学问题带来了突破性进展。阿里云飞天实验室算法专家贺勇则表示,这项研究成果刷新了人类对病毒世界的认知,有助于提前预警未来大流行,并推动RNA病毒疫苗的研发。
据了解,阿里云近年来积极与国内科研机构合作,在生命科学领域已取得一系列重要成果,例如开发了核酸和蛋白质统一基础模型LucaOne等。
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